注意しましょう！

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【ホスティング・レンタルサーバでの活用】 ... 例えば、ホスティング・レンタルサーバ事業を展開しているアット・ワイエムシーでは、2006年7月からVPS(Virtual Private Server:root権限を保有できる自由度の高いレンタルサーバ ...
http://j-net21.smrj.go.jp/develop/digital/entry/001-20090401-04.html

futomi's CGI Cafe - 高機能アクセス解析CGI ...
月指定、日付指定での解析も可能。 ... お使いのプロバイダー、レンタルサーバ業者の指示に従ってください。 ... CGI がオーナー権限で実行されるか、other 権限で実行されるかは、お使いのプロバイダーもしくはレンタルサーバ業者に確認してください。 ...
http://www.gender.go.jp/ffats/acc/ReadMe/ReadMe.html

平成２０年１月 警察 庁
レンタルサーバ(無料レンタル掲示板)管理者が、 出会い系事業者の氏名等を把握していない場合は、 ... ＩＳＰやレンタルサーバが海外に. あるので、報告徴収が行えない。 ... 関係者の協力を求める場合、電気通信事業者(プロバイダ 、レンタルサーバ会 ...
http://www.npa.go.jp/cyber/deaimeeting/h19/doc0/deai_pubcome_annai.pdf

複数ドメインを取得してひとつのレンタルサーバーで利用することはできるのでしょうか？
レンタルサーバーの種類によって、可否がるのであれば、対応可能でお勧めのレンタルサーバーをご教示いただけると幸いです。
複数ドメインを利用できる機能を一般的にマルチドメインと言います。
最近多くなってきました。
安いのがよければさくらのレンラルサーバライト。
125円/月http://www.sakura.ne.jp/rentalserver/lite/index.html20ドメインまで設定可能です。
安いに徹するならコレですね。
ただ、ディレクトリやメールアドレスに制限があるため、ウェブサイトのみならばいいと思いますが、メールまで運用したいのでしたらあまり向いていないかもしれません。
私はエックスサーバを利用しています。
http://www.xserver.ne.jp/ 1050円/月ドメイン数無制限。
サブドメイン無制限。
コントロールパネルの操作性も良いし、アクセス解析も高性能。
ワンクリックでMTとかインストールできますし私は気に入っています。
他にもたくさんあります。
レンサバCOMの供用サーバＳＤ（ドメイン数無制限）http://www.rensaba.com/デジロックのXREAhttp://www.value-domain.com/xrea.php （ドメイン数10～20個）などが有名でしょうか。
利用したことがないので回答は控えます。
（レンタルサーバについての質問をすると自分のアフィリエイトサイトに誘導する人多いですのでご留意ください）